Соглашение о сохранении популяций европейских летучих мышей (EUROBATS) было создано в 1991 году под эгидой CMS после признания неблагоприятного природоохранного статуса летучих мышей в Европе, Северной Африке и на Ближнем Востоке. Он занимается 52 видами летучих мышей, обитающих на территории Соглашения. К настоящему времени к Соглашению присоединились 35 из 63 стран ареала. Его основная цель - создать основу для сотрудничества стран-участниц и тех, кто еще не присоединился, в целях сохранения летучих мышей в Европе и за ее пределами.

Секретариат ЕВРОБАТС начал свою работу в Бонне в 1996 году. Он координирует и организует деятельность Постоянного и Консультативного комитетов и организует встречи Сторон. Он также осуществляет инициативы по реализации Соглашения, привлечению новых государств-членов, повышению осведомленности общественности, обмену информацией, координации международных исследований и инициатив по мониторингу.

В 2001 году Соглашение ЕВРОБАТС стало частью Программы ООН по окружающей среде (ЮНЕП). Оно служит успешной моделью для продвижения аналогичных структур соглашений по сохранению летучих мышей на других континентах.