Боннський університет імені Фрідріха-Вільгельма, якому вже понад 200 років, є міжнародним дослідницьким університетом, орієнтованим на співпрацю та фокусування на дослідженнях, з широким спектром навчальних програм, що налічує близько 200 бакалаврських та магістерських курсів, деякі з яких є заочною формою навчання. На семи факультетах цього багатопрофільного університету навчається понад 31 000 осіб, близько 4 500 з яких приїжджають з-за кордону. Близько 1 700 з 6 400 докторантів - іноземні громадяни. В університеті працює близько 7 700 співробітників, у тому числі 692 професори. Разом з Університетською лікарнею Бонна, в якій працює понад 8 300 співробітників, він є одним з найбільших роботодавців у регіоні. Понад 300 університетів-партнерів по всьому світу представляють чудову міжнародну мережу.

Завдяки своїм шести кластерам досконалості та успішній загальній концепції, з 2019 року університет має статус Університету досконалості. Серед іншого, цей статус дозволяє університету розширювати свої міжнародні позиції та краще набирати викладачів. Місто Бонн підтримує Боннський університет у його проектах через спільний "Меморандум про взаєморозуміння", який регулює основи співпраці та її розвиток. Регулярні обміни відбуваються на різних рівнях. Агентство економічного розвитку тісно співпрацює з університетом, наприклад, у сферах кар'єрного консультування, підтримки стартапів та інновацій, а також наукової комунікації. З цією метою вона тісно співпрацює з Центром трансферу enaCom, Службою кар'єри, Відділом міжнародних зв'язків та різними інститутами університету. Співпраця між enaCOM та Digital Hub Region Bonn робить діяльність стартапів ще більш помітною в центрі Бонна. Боннський університет є важливим гравцем у проекті Центру сталого розвитку Боннського регіону.

Заснований у 1995 році, університет налічує близько 9 000 студентів і близько 1 100 співробітників, у тому числі 150 професорів. Наразі він пропонує близько 40 бакалаврських та магістерських програм у Сант-Августіні, Райнбаху та Хеннефі. Більше половини з 1300 випускників, які щорічно випускаються, залишаються працювати в регіоні. Надання Докторській колегії Північного Рейн-Вестфалії незалежного права присуджувати докторські ступені уможливлює незалежну процедуру докторантури в H-BRS. Центр трансферу науки і технологій ZWT сприяє співпраці з компаніями та організаціями, а також консультує щодо програм фінансування та аспектів експлуатації. Боннське агентство економічного розвитку тісно співпрацює з ZWT та CENTIM (Центром підприємництва, інновацій та МСП) і підтримує Start-up-Manufaktur. Це ініціатива проекту SUPRA (Start-up Program Rheinbach Sankt Augustin), який фінансується Федеральним міністерством економіки та енергетики в рамках програми EXIST. H-BRS також робить свій внесок у роботу Центру сталого розвитку Боннського регіону.

Університет мистецтв та соціальних наук Алануса - це визнаний державою мистецький університет з двома кампусами (в Альфері та Мангеймі), який є частиною боннської мистецької сцени. Університет, який у 2023 році відсвяткував своє 50-річчя, наразі налічує близько 2 000 студентів і понад 250 співробітників (у тому числі близько 90 професорів) та пропонує 32 навчальні програми на денній та заочній формах навчання. Розширюються контакти з місцевими компаніями, зокрема на факультеті бізнесу, в тому числі в рамках спільного проєкту Sustainability Hub Region Bonn.

Кампус RheinAhrCampus Remagen - одне з трьох місць розташування Університету прикладних наук Кобленца. Сильна практична спрямованість навчання та викладання міждисциплінарних знань у галузях "Математика і техніка" та "Економіка і соціальні науки" готують близько 2 500 студентів на близько 20 навчальних курсах до ринку праці. Як регіональний центр інновацій та послуг, кампус інтегрований у регіональну мережу охорони здоров'я та науковий регіон, а також пропонує численні курси дистанційного навчання з неповним робочим днем. Агенція економічного розвитку тісно співпрацює з університетом у сферах трансферу, регіонального розвитку, підтримки стартапів та забезпечення кваліфікованими працівниками.

На початку 2022 року дослідницький центр "Цезар" став Інститутом нейробіології поведінки Макса Планка. Інститут, який раніше був пов'язаний з Дослідницьким фондом, відтоді став повноправним членом Товариства Макса Планка.

Найбільше в ЄС місце розташування Європейського центру середньострокових прогнозів погоди (ECMWF) зміцнить Бонн як наукову локацію в галузі досліджень клімату та сталого розвитку. ECMWF є світовим науковим лідером у галузі прогнозування погоди та кліматології. Серед іншого, він виконує свої завдання в програмі ЄС зі спостереження Землі "Коперник" з Бонна.

Шість інститутів Фраунгофера, розташовані в Бонні, Санкт-Августині, Вахтберзі та Еускірхені, в яких працюють понад 1900 співробітників, є прикладом неуніверситетських передових досліджень в галузі ІКТ-технологій і формують інтерфейс між наукою та промисловістю.

З метою подальшого розвитку дослідницького портфоліо Fraunhofer-Gesellschaft у сферах "Технологічний аналіз та стратегічне планування" та "Радіаційні ефекти", Інститут аналізу технологічних тенденцій INT буде інтегрований до Інституту комунікації, обробки інформації та ергономіки FKIE в майбутньому.

Разом з Боннським університетом, Аахенським університетом RWTH та Університетом прикладних наук Бонн-Рейн-Зіг, Центр Фраунгоферівського інституту в Бірлінгховені є частиною Бонн-Аахенського міжнародного центру інформаційних технологій. Курс "Кібербезпека" в Боннському університеті є лише одним із прикладів тісної співпраці між Інститутами Фраунгофера та університетами. Боннське агентство економічного розвитку бере активну участь в опікунських радах Fraunhofer FKIE та Fraunhofer SCAI.