Рейнский университет имени Фридриха Вильгельма в Бонне, которому уже более 200 лет, является действующим на международном уровне исследовательским университетом, ориентированным на сотрудничество и целенаправленную работу, с широким выбором из примерно 200 курсов бакалавриата и магистратуры, некоторые из которых являются заочными. На семи факультетах этого многопрофильного университета обучается более 31 000 человек, из них около 4500 приезжают из-за рубежа. Около 1700 из 6400 докторантов - иностранные граждане. В университете работает около 7700 сотрудников, включая 692 профессора. Вместе с Боннской университетской больницей, в которой работает более 8 300 человек, он является одним из крупнейших работодателей в регионе. Более 300 университетов-партнеров по всему миру представляют отличную международную сеть.

Благодаря шести кластерам превосходства и успешной общей концепции университет с 2019 года является университетом превосходства. Этот статус, помимо прочего, позволяет университету расширять свои международные позиции и лучше набирать ученых. Город Бонн поддерживает Боннский университет в его проектах посредством совместного "Меморандума о взаимопонимании", который регулирует основы сотрудничества и его развитие. Регулярные обмены происходят на разных уровнях. Агентство экономического развития тесно сотрудничает с университетом, например, в области карьерного консультирования, поддержки стартапов и инноваций, а также научной коммуникации. Для этого оно тесно сотрудничает с Трансферным центром enaCom, Службой карьеры, Департаментом международных отношений и различными университетскими институтами. Сотрудничество между enaCom и Digital Hub Region Bonn делает деятельность стартапов еще более заметной в центре Бонна. Боннский университет является важным участником проекта "Устойчивый центр региона Бонн".

Основанный в 1995 году, университет насчитывает около 9 000 студентов и около 1 100 сотрудников, включая 150 профессоров. В настоящее время университет предлагает около 40 программ бакалавриата и магистратуры в Сант-Августине, Райнбахе и Хеннефе. Более половины из 1300 выпускников ежегодно остаются работать в регионе. Получение Докторским колледжем Северного Рейнгольда независимого права на присвоение докторских степеней позволяет проводить независимую процедуру докторантуры в H-BRS. Центр трансфера науки и технологий ZWT содействует сотрудничеству с компаниями и организациями, консультирует по программам финансирования и аспектам эксплуатации. Агентство экономического развития Бонна тесно сотрудничает с ZWT и Центром предпринимательства, инноваций и малого и среднего бизнеса (CENTIM) и поддерживает Start-up-Manufaktur. Это инициатива проекта SUPRA (Start-up Program Rheinbach Sankt Augustin), который финансируется Федеральным министерством экономики и энергетики в рамках программы EXIST. H-BRS также вносит свой вклад в работу Центра устойчивого развития региона Бонн.

Университет искусств и социальных наук Аланус - это признанный государством университет искусств с двумя отделениями (в Альфтере и Мангейме) и часть боннской арт-сцены. В университете, отметившем в 2023 году свое 50-летие, в настоящее время обучается около 2 000 студентов и работает более 250 сотрудников (в том числе около 90 профессоров), предлагая 32 программы полного и неполного обучения. Расширяются контакты с местными компаниями, особенно на факультете бизнеса, в том числе в рамках совместного проекта Sustainability Hub Region Bonn.

RheinAhrCampus Remagen - один из трех филиалов Университета прикладных наук Кобленца. Сильная практическая направленность курсов и преподавание междисциплинарных знаний в областях "Математика и техника" и "Экономика и социальные науки" готовят около 2 500 студентов по 20 курсам к выходу на рынок труда. Будучи региональным центром инноваций и услуг, кампус интегрирован в региональную сеть здравоохранения и научный регион, а также предлагает многочисленные заочные курсы дистанционного обучения. Агентство экономического развития тесно сотрудничает с университетом в области трансфера, регионального развития, поддержки стартапов и привлечения квалифицированных кадров.

В начале 2022 года исследовательский центр "Цезарь" стал Институтом нейробиологии поведения имени Макса Планка. Институт, который ранее был связан с Исследовательским фондом, с тех пор стал полноправным членом Общества Макса Планка.

Крупнейшее в ЕС расположение Европейского центра прогнозов погоды средней дальности (ECMWF) укрепит Бонн в качестве научного центра в области исследований климата и устойчивого развития. ECMWF является мировым научным лидером в области прогнозирования погоды и климатологии. Помимо прочего, он выполняет свои задачи в рамках программы ЕС по наблюдению Земли "Коперник" из Бонна.

Шесть институтов Фраунгофера, расположенных в Бонне, Санкт-Августине, Вахтберге и Эускирхене и насчитывающих более 1900 сотрудников, занимаются внеуниверситетскими передовыми исследованиями в области ИКТ-технологий и формируют интерфейс между наукой и промышленностью.

Для дальнейшего развития исследовательского портфеля Фраунгофер-Гезельшафт в областях "Анализ технологий и стратегическое планирование" и "Радиационное воздействие" Институт Фраунгофера по анализу технологических тенденций INT в будущем будет интегрирован в Институт Фраунгофера по коммуникации, обработке информации и эргономике FKIE.

Вместе с Боннским университетом, Университетом RWTH Aachen и Университетом прикладных наук Бонн-Райн-Зиг Институтский центр Фраунгофера в Бирлингховене является частью Международного центра информационных технологий Бонн-Аахен. Курс по кибербезопасности в Боннском университете - лишь один из примеров тесного сотрудничества между институтами Фраунгофера и университетами. Агентство экономического развития Бонна активно участвует в работе попечительских советов Fraunhofer FKIE и Fraunhofer SCAI.