Після початкової школи діти переходять до середньої школи. Це може бути Hauptschule (середня загальноосвітня школа), Realschule (середня загальноосвітня школа), Gymnasium (гімназія), Sekundarschule (новий тип середньої школи в Північному Рейні-Вестфалії) або Gesamtschule (загальноосвітня школа).

Наразі в Бонні немає семирічної школи.

У четвертому класі початкової школи учні отримують інформацію про різні типи шкіл та їхні вимоги до успішності, а також про пропозиції місцевих шкіл. Після цього класний керівник і батьки проводять особисту бесіду про подальшу освіту дитини. У табелі успішності за друге півріччя четвертого класу початкова школа вказує рекомендацію щодо конкретного типу школи, запропонованого вчителями. Також видається реєстраційний бланк.

Поряд з рекомендацією щодо типу школи з трьох гілок шкільної системи - Hauptschule (середня загальноосвітня школа), Realschule (середня загальноосвітня школа) або Gymnasium (гімназія) - завжди вказується також Gesamtschule (гімназія) і Sekundarschule (новий тип середньої школи в землі Північний Рейн-Вестфалія), оскільки до цих шкіл можуть ходити діти з дуже різними здібностями.

Якщо дитина має право на навчання в школі третього типу з обмеженнями, початкова школа також вказує на це.

Процес реєстрації в середній школі:
Батьки записують дитину з табелем успішності за друге півріччя четвертого класу та заявою про зарахування до школи, що продовжує навчання. Директор школи вирішує, чи буде дитина прийнята.

Батьки повинні заздалегідь зв'язатися з обраною школою, щоб домовитися про зустріч для обговорення можливості зарахування їхньої дитини. Зустрічі починаються набагато раніше, ніж роздаються табелі успішності за півріччя та реєстраційні форми.

Також можна скористатися "днями відкритих дверей" ("Tage der offenen Tür"), на які запрошують усі боннські школи, що продовжують навчання, щоб встановити контакт.