Après l'école primaire, les enfants passent à l'école secondaire. Il peut s'agir d'une Hauptschule (école secondaire générale), d'une Realschule (école secondaire intermédiaire), d'un Gymnasium (lycée), d'une Sekundarschule (un nouveau type d'école secondaire en Rhénanie-du-Nord-Westphalie) ou d'une Gesamtschule (école polyvalente).

Actuellement, il n'y a pas de Sekundarschule à Bonn.

L'école primaire informe au cours de la quatrième année sur les différents types d'écoles et leurs exigences en matière de performances, ainsi que sur l'offre scolaire locale. Ensuite, l'enseignant de la classe et les parents ont un entretien personnel sur la poursuite des études de l'enfant. L'école primaire indique dans le bulletin de la deuxième moitié de la quatrième année un avis sur le type d'école spécifique proposé par les enseignants. Un formulaire d'inscription est également délivré.

Outre l'indication du type d'école du système scolaire à trois branches - Hauptschule (école secondaire générale), Realschule (école secondaire intermédiaire) ou Gymnasium (lycée) -, la Gesamtschule (école polyvalente) et la Sekundarschule (un nouveau type d'école secondaire en Rhénanie-du-Nord-Westphalie) sont également toujours mentionnées, car des enfants ayant des aptitudes très différentes peuvent fréquenter ces écoles.

Si un enfant est qualifié pour un troisième type d'école avec des restrictions, l'école primaire le précise également.

Procédure d'inscription à l'école secondaire :
Les parents inscrivent leur enfant avec le bulletin scolaire de la deuxième moitié de la quatrième année et le formulaire d'inscription à l'école permanente. Le directeur de l'école décide si l'enfant est accepté ou non.

Les parents doivent prendre contact rapidement avec l'école de leur choix afin d'obtenir un rendez-vous pour convenir de l'admission éventuelle de leur enfant. Les réunions commencent bien avant la remise des bulletins de notes du semestre et des formulaires d'inscription.

Les "journées de la porte ouverte" ("Tage der offenen Tür"), auxquelles sont invitées toutes les écoles de formation continue de Bonn, peuvent également être utilisées pour prendre contact.