Después de la escuela primaria, los niños pasan a la escuela secundaria. Puede ser una Hauptschule (escuela secundaria general), una Realschule (escuela secundaria intermedia), un Gymnasium (instituto de bachillerato), una Sekundarschule (un nuevo tipo de escuela secundaria en Renania del Norte-Westfalia) o una Gesamtschule (escuela integral).

Actualmente, no hay ninguna Sekundarschule en Bonn.

La escuela primaria informa durante el cuarto curso sobre los distintos tipos de escuela y sus requisitos de rendimiento, así como sobre la oferta escolar local. Después, el profesor de la clase y los padres tienen una charla personal sobre la educación posterior del niño. La escuela primaria indica en el boletín de notas del segundo semestre de cuarto curso el tipo de escuela que sugieren los profesores. También se entrega un formulario de inscripción.

Junto al consejo sobre el tipo de escuela del sistema escolar de tres ramas - Hauptschule (escuela secundaria general), Realschule (escuela secundaria intermedia) o Gymnasium (instituto de bachillerato) -, también se nombran siempre la Gesamtschule (escuela integral) y la Sekundarschule (un nuevo tipo de escuela secundaria en Renania del Norte-Westfalia) porque a estas escuelas pueden ir niños con aptitudes muy diferentes.

Si un niño está cualificado para un tercer tipo de escuela con restricciones, la escuela primaria también lo especifica.

Proceso de inscripción en la escuela secundaria
Los padres inscriben a su hijo con el boletín de notas de la segunda mitad del cuarto curso y el formulario de inscripción en la escuela de continuación. El director de la escuela decide si se acepta al niño.

Los padres deben ponerse en contacto pronto con el centro preferido para concertar una reunión y acordar la posible admisión de su hijo. Las reuniones empiezan mucho antes de que se entreguen los boletines de notas semestrales y los impresos de matrícula.

Los "días de puertas abiertas" ("Tage der offenen Tür"), a los que invitan todas las escuelas permanentes de Bonn, pueden servir también para ponerse en contacto.