L'Accordo sulla conservazione dei piccoli cetacei del Mar Baltico e del Mare del Nord (ASCOBANS) è stato concluso sotto gli auspici della CMS nel 1991.

Dal gennaio 2007, il Segretariato della Convenzione madre di ASCOBANS, la CMS (Convenzione sulla conservazione delle specie migratorie della fauna selvatica), fornisce i servizi di Segretariato per l'Accordo. Il Segretariato congiunto, amministrato dal Programma delle Nazioni Unite per l'Ambiente (UNEP), ha sede a Bonn. Fornisce supporto amministrativo, raccoglie e distribuisce informazioni rilevanti per l'attuazione dell'Accordo e organizza, prepara e gestisce le riunioni degli organi decisionali e consultivi dell'Accordo. Si occupa inoltre di sensibilizzare l'opinione pubblica sulle minacce che incombono su questi animali.