El Acuerdo sobre la Conservación de los Pequeños Cetáceos del Mar Báltico y el Mar del Norte (ASCOBANS) se celebró bajo los auspicios de la CMS en 1991.

Desde enero de 2007, la Secretaría de la Convención madre del ASCOBANS, la CMS (Convención sobre la Conservación de las Especies Migratorias de Animales Silvestres), presta los servicios de Secretaría del Acuerdo. La Secretaría conjunta, administrada por el Programa de las Naciones Unidas para el Medio Ambiente (PNUMA), tiene su sede en Bonn. Proporciona apoyo administrativo, recopila y distribuye información relevante para la aplicación del Acuerdo y organiza, prepara y presta servicios a las reuniones de los órganos decisorios y consultivos del Acuerdo. También se ocupa de sensibilizar a la opinión pública sobre las amenazas que pesan sobre estos animales.