Федеральне відомство з охорони природи є федеральним відомством, підпорядкованим Федеральному міністерству навколишнього середовища, охорони природи та ядерної безпеки (BMU). Воно є консультантом BMU з усіх питань, пов'язаних із захистом природи та сільської місцевості на національному та міжнародному рівнях; сприяє реалізації природоохоронних проектів, підтримує дослідницькі програми та є органом, який приймає рішення щодо імпорту та експорту видів рослин і тварин, що перебувають під охороною. BfN має філії в Лейпцигу та на острові Вільм поблизу Рюгена (Східна Німеччина).