Federalny Urząd Ochrony Przyrody jest organem federalnym powiązanym z Federalnym Ministerstwem Środowiska, Ochrony Przyrody i Bezpieczeństwa Jądrowego (BMU). Jest konsultantem BMU we wszystkich problemach związanych z krajową i międzynarodową ochroną przyrody i krajobrazu; promuje projekty ochrony przyrody, wspiera programy badawcze i jest organem decydującym o imporcie i eksporcie chronionych gatunków roślin i zwierząt. BfN ma oddziały w Lipsku i na wyspie Vilm w pobliżu Rugii (wschodnie Niemcy).